Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF248Q8NDW4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF248Q8NDW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms