Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBS3

SLC4A11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A11Q8NBS3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC4A11Q8NBS3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC4A11Q8NBS3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A11Q8NBS3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms