Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN7

RDH13, Retinol dehydrogenase 13, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13Q8NBN7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RDH13Q8NBN7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RDH13Q8NBN7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RDH13Q8NBN7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RDH13Q8NBN7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms