Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBE8

KLHL23, Kelch-like protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL23Q8NBE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KLHL23Q8NBE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KLHL23Q8NBE8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KLHL23Q8NBE8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms