Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
USP38Q8NB14 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
USP38Q8NB14 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
USP38Q8NB14 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms