Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATG16L2Q8NAA4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG16L2Q8NAA4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms