Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA29

MFSD2A, Sodium-dependent lysophosphatidylcholine symporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD2AQ8NA29 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MFSD2AQ8NA29 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MFSD2AQ8NA29 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MFSD2AQ8NA29 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms