Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF148Q8N7C7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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RNF148Q8N7C7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF148Q8N7C7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF148Q8N7C7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
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