Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Y2

LRRC17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC17Q8N6Y2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC17Q8N6Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC17Q8N6Y2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC17Q8N6Y2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms