Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00337Q8N6G1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00337Q8N6G1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00337Q8N6G1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms