Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5M1

ATPAF2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPAF2Q8N5M1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ATPAF2Q8N5M1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATPAF2Q8N5M1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATPAF2Q8N5M1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATPAF2Q8N5M1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATPAF2Q8N5M1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms