Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B4

FBXO39, F-box only protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO39Q8N4B4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO39Q8N4B4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FBXO39Q8N4B4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FBXO39Q8N4B4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms