Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 DLEU1-207ENST00000467721 1455 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.695e-9■■■■■ 35.8
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AGGF1Q8N302 DLEU1-209ENST00000468522 1158 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.735e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-234ENST00000491615 1451 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.775e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-206ENST00000463474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.915e-9■■■■■ 35.8
AGGF1Q8N302 DLEU1-228ENST00000485007 736 ntTSL 59.04□□□□□ -0.965e-9■■■■■ 35.8
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AGGF1Q8N302 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.246e-8■■■■■ 35.7
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AGGF1Q8N302 CMSS1-208ENST00000496116 2145 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.586e-8■■■■■ 35.7
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AGGF1Q8N302 EXOC4-216ENST00000482089 628 ntTSL 47.69□□□□□ -1.186e-8■■■■■ 35.7
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AGGF1Q8N302 TNFAIP2-208ENST00000560670 1334 ntTSL 213.13□□□□□ -0.313e-6■■■■■ 35.6
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AGGF1Q8N302 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.596e-10■■■■■ 35.6
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AGGF1Q8N302 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.886e-10■■■■■ 35.6
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AGGF1Q8N302 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.341e-7■■■■■ 35.5
AGGF1Q8N302 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 35.5
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AGGF1Q8N302 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.437e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 PIGP-202ENST00000360525 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.017e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.077e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 PIGP-201ENST00000329667 562 ntTSL 27.71□□□□□ -1.187e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.27e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.427e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.957e-11■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 AHDC1-203ENST00000480033 546 ntTSL 516.99■□□□□ 0.319e-8■■■■■ 35.4
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AGGF1Q8N302 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 516.52■□□□□ 0.249e-8■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.249e-8■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 RAD51B-223ENST00000556251 567 ntTSL 45.64□□□□□ -1.512e-6■■■■■ 35.4
AGGF1Q8N302 SELENON-205ENST00000630065 2994 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.993e-8■■■■■ 35.3
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