Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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CA13Q8N1Q1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CA13Q8N1Q1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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CA13Q8N1Q1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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CA13Q8N1Q1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CA13Q8N1Q1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
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