Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1L1

LINC00528, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00528, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00528Q8N1L1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00528Q8N1L1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00528Q8N1L1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms