Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC170Q8IYT3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC170Q8IYT3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC170Q8IYT3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms