Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NELFCDQ8IXH7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NELFCDQ8IXH7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NELFCDQ8IXH7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms