Protein–RNA interactions for Protein: Q86YH6

PDSS2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS2Q86YH6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PDSS2Q86YH6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDSS2Q86YH6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDSS2Q86YH6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms