Protein–RNA interactions for Protein: Q86WR0

CCDC25, Coiled-coil domain-containing protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC25Q86WR0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC25Q86WR0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC25Q86WR0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC25Q86WR0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms