Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PACS2Q86VP3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PACS2Q86VP3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PACS2Q86VP3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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