Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALYREFQ86V81 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALYREFQ86V81 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALYREFQ86V81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALYREFQ86V81 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
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