Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ZNF554Q86TJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ZNF554Q86TJ5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ZNF554Q86TJ5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms