Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBBP6Q7Z6E9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBBP6Q7Z6E9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBBP6Q7Z6E9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RBBP6Q7Z6E9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms