Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CACNA2D4Q7Z3S7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms