Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HS2ST1Q7LGA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HS2ST1Q7LGA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HS2ST1Q7LGA3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms