Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAXIP1Q6ZW49 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAXIP1Q6ZW49 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PAXIP1Q6ZW49 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PAXIP1Q6ZW49 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAXIP1Q6ZW49 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms