Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LINC00336Q6ZUF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LINC00336Q6ZUF6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110 ms