Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTW0

TPGS1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1Q6ZTW0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPGS1Q6ZTW0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TPGS1Q6ZTW0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TPGS1Q6ZTW0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms