Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSJ9

SHISA6, Protein shisa-6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA6Q6ZSJ9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SHISA6Q6ZSJ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SHISA6Q6ZSJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHISA6Q6ZSJ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms