Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HACD2Q6Y1H2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HACD2Q6Y1H2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HACD2Q6Y1H2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms