Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMCO3Q6UWJ1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMCO3Q6UWJ1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMCO3Q6UWJ1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms