Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CBLN3Q6UW01 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CBLN3Q6UW01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CBLN3Q6UW01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.5 ms