Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHBDF2Q6PJF5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHBDF2Q6PJF5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHBDF2Q6PJF5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 407.5 ms