Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CASC4Q6P4E1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CASC4Q6P4E1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CASC4Q6P4E1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms