Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 MDH1-201ENST00000233114 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.341e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 ATF7IP-215ENST00000541056 570 ntTSL 46.61□□□□□ -1.351e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 UBA1-203ENST00000377351 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.354e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SPAG5-207ENST00000580083 978 ntTSL 36.48□□□□□ -1.371e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 KIF14-201ENST00000367350 7274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.381e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 TRNAU1AP-202ENST00000411406 450 ntTSL 26.42□□□□□ -1.381e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SPTBN1-202ENST00000356805 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.391e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 ATF7IP-212ENST00000539057 573 ntTSL 46.31□□□□□ -1.41e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 TMEM164-201ENST00000288381 5452 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.411e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SPTBN1-201ENST00000333896 9075 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 TCP1-218ENST00000546204 566 ntTSL 26.15□□□□□ -1.421e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.441e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CENPO-204ENST00000464156 660 ntTSL 26.04□□□□□ -1.441e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AK4-201ENST00000327299 6836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.451e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SPTBN1-207ENST00000615901 10226 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.461e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SLC25A24-202ENST00000370041 3404 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.461e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SPAG5-216ENST00000584206 715 ntTSL 45.81□□□□□ -1.481e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SAT1-207ENST00000474223 1033 ntTSL 25.51□□□□□ -1.534e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 RBSN-201ENST00000253699 6678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.541e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.541e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MED13L-202ENST00000548694 880 ntTSL 55.19□□□□□ -1.581e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.61e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MDH1-206ENST00000436321 680 ntTSL 35.05□□□□□ -1.61e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ACSM3-207ENST00000562251 1931 ntTSL 25.03□□□□□ -1.614e-8■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.611e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MACF1-224ENST00000496804 5065 ntTSL 54.87□□□□□ -1.631e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 RBSN-202ENST00000426541 664 ntTSL 34.75□□□□□ -1.651e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ATF7IP-204ENST00000534828 550 ntTSL 34.72□□□□□ -1.651e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.711e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 CHD6-206ENST00000470470 1349 ntTSL 54.25□□□□□ -1.731e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.16□□□□□ -1.741e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.761e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 GOLGB1-208ENST00000494517 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.72□□□□□ -1.811e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 ZNF138-203ENST00000430838 2308 ntTSL 23.7□□□□□ -1.821e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.831e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 GOLGB1-206ENST00000489400 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 23.22□□□□□ -1.891e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.131e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 MDH1-204ENST00000421012 573 ntTSL 41.65□□□□□ -2.151e-5■■■■□ 22.3
NIPBLQ6KC79 SAT1-205ENST00000462639 826 ntTSL 21.55□□□□□ -2.164e-8■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 ATP13A3-204ENST00000446356 542 ntTSL 4-0.28□□□□□ -2.451e-5■■■■□ 22.3
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NIPBLQ6KC79 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-9■■■■□ 22.2
NIPBLQ6KC79 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.283e-9■■■■□ 22.2
NIPBLQ6KC79 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.53e-9■■■■□ 22.2
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NIPBLQ6KC79 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-6■■■■□ 21.9
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NIPBLQ6KC79 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.99e-7■■■■□ 21.7
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NIPBLQ6KC79 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.943e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 DGCR2-202ENST00000389262 4814 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.013e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 BPTF-205ENST00000424123 8295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.6□□□□□ -1.839e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 ST3GAL2-204ENST00000566097 904 ntTSL 224.31■■□□□ 1.482e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 ST3GAL2-203ENST00000561708 581 ntTSL 414.99□□□□□ -0.012e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.722e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.384e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.444e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 EEF1B2-205ENST00000429769 912 ntTSL 511.48□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 EEF1B2-208ENST00000455150 670 ntTSL 56.15□□□□□ -1.424e-7■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-202ENST00000341028 881 ntTSL 219.08■□□□□ 0.651e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-206ENST00000615951 2227 ntTSL 1 (best)13.16□□□□□ -0.31e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.521e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.561e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.61e-6■■■■□ 21.7
NIPBLQ6KC79 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.611e-6■■■■□ 21.7
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