Protein–RNA interactions for Protein: Q6A555

TXNDC8, Thioredoxin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC8Q6A555 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TXNDC8Q6A555 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TXNDC8Q6A555 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TXNDC8Q6A555 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms