Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALS2CLQ60I27 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALS2CLQ60I27 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALS2CLQ60I27 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms