Protein–RNA interactions for Protein: Q5TYX0

PRAMEF5, PRAME family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF5Q5TYX0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRAMEF5Q5TYX0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PRAMEF5Q5TYX0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms