Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LIN9Q5TKA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LIN9Q5TKA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LIN9Q5TKA1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms