Protein–RNA interactions for Protein: Q5TA31

RNF187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF187Q5TA31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF187Q5TA31 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RNF187Q5TA31 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RNF187Q5TA31 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms