Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1J5

CHCHD2P9, Putative coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein CHCHD2P9, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P9Q5T1J5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHCHD2P9Q5T1J5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHCHD2P9Q5T1J5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHCHD2P9Q5T1J5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms