Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CEP170Q5SW79 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
CEP170Q5SW79 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
CEP170Q5SW79 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
CEP170Q5SW79 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms