Protein–RNA interactions for Protein: Q5QJU3

ACER2, Alkaline ceramidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER2Q5QJU3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACER2Q5QJU3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ACER2Q5QJU3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACER2Q5QJU3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACER2Q5QJU3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACER2Q5QJU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ACER2Q5QJU3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms