Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HERC4Q5GLZ8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HERC4Q5GLZ8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HERC4Q5GLZ8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms