Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRRT3Q5FWE3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRRT3Q5FWE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRRT3Q5FWE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms