Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CMPK2Q5EBM0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CMPK2Q5EBM0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms