Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAVIN4Q5BKX8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAVIN4Q5BKX8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CAVIN4Q5BKX8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CAVIN4Q5BKX8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms