Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Q56UQ5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q56UQ5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q56UQ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Q56UQ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Q56UQ5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Q56UQ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Q56UQ5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q56UQ5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q56UQ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Q56UQ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Q56UQ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q56UQ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Q56UQ5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms