Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGO2Q562F6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SGO2Q562F6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SGO2Q562F6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms