Protein–RNA interactions for Protein: Q52LC2

ATP6AP1L, V-type proton ATPase subunit S1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP6AP1LQ52LC2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6AP1LQ52LC2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6AP1LQ52LC2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms